FFIP

AcronymDefinition
FFIPFunction-Failure Identification and Propagation
FFIPForum for International Policy (Washington, DC)
FFIPFriends and Family of Incarcerated Persons
FFIPFirm-Fixed-Incentive-Price (Contract)
FFIPFed Funds Implied Probability
FFIPFuture Faculty Internship Program (joint training program; Chicago, IL)
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El ADN extraido de tejidos FFIP es adecuado para amplificacion a traves de la reaccion en cadena de la polimerasa (RCP) y existen muchos estudios que han demostrado la utilidad del analisis genetico basado en RCP con tejidos FFIP (Akao et al., 1991; Sato et al., 2001), no solo para estudiar alteraciones del genoma humano, sino tambien para el diagnostico de patogenos de importancia como virus y bacterias, en los cuales las tecnicas de deteccion microbiologica convencionales pueden ser laboriosas y tomar varios dias antes de obtener un resultado (Yang et al., 2004; Mahaisavariya et al., 2005; Dedhia et al., 2007).
Sin embargo, en algunos casos es dificil obtener grandes fragmentos de ADN a partir de tejidos FFIP debido a que el acido formico generado en la solucion de formaldehido al 10%, el tiempo de fijacion y el periodo de almacenamiento de los tejidos en bloques de parafina afecta la calidad del ADN.
Los metodos tradicionales para aislamiento de ADN de tejidos FFIP utilizan xilol como agente removedor de parafina, seguido de purificacion con fenol/cloroformo, lo cual requiere multiples pasos con una prolongada duracion y riesgo de contaminacion cruzada con otras muestras que se esten procesando al mismo tiempo (Howe et al., 1997; Yang et al., 2004).
En este estudio, se aplicaron tres metodos para extraccion de ADN en una serie de tejidos FFIP, con el objetivo de comparar la eficiencia de estos para producir ADN de buena calidad y cantidad.
Se analizaron tres bloques de tejidos FFIP, archivados en el Laboratorio de Patologia del Hospital Universitario del Caribe (Cartagena, Colombia), que habian sido previamente utilizados para estudio histopatologico y diagnostico.
En general el ADN genomico oscilo entre 900 pb y 300 pb, lo cual es comunmente observado en ADN extraido de tejidos FFIP. Se observaron diferencias en las corridas electroforeticas; los patrones de ADN de los metodos A (salting out) y C (kit comercial) fueron muy similares, obteniendose una banda homogeneamente tenida entre 500 pb y 700 pb.
Los tejidos FFIP constituyen un archivo de especimenes humanos unicos.
Actualmente existen multiples metodos de extraccion de ADN de tejidos FFIP publicados, disenados con el fin de mejorar la efectividad de la amplificacion por RCP.
Si bien, existen en la actualidad diversas pruebas comerciales especificamente disenadas para extraer ADN de tejidos FFIP, las cuales permiten aislar ADN de buena calidad para RCP y procesos de secuenciacion, en laboratorios y proyectos con presupuesto limitado la tecnica de salting out modificada es una buena alternativa para llevar a cabo las extracciones de ADN de tejidos FFIP.
En conclusion, aunque obtener ADN de tejidos FFIP es un desafio debido a que no siempre es posible obtener fragmentos de gran tamano y en algunos laboratorios no tenemos a disposicion kits comerciales para llevar a cabo este proceso, la tecnica de extraccion por salting out modificada en este estudio es una forma rapida, pues acorta el periodo de digestion en 1 a 2 dias y con poca toxicidad, debido a la utilizacion de NaCl como agente precipitante, que permite obtener ADN de buena cantidad y de buena longitud para amplificacion por RCP convencional.